Le piccole dimensioni dell'isola di Formentera così come la scarsa differenza d'altitudine fanno sì che le caratteristiche climatiche varino molto poco da un punto all'altro. Ci sono piccole variazioni, principalmente della temperatura e dell'umidità, fra le parti più basse dell'isola ed i promontori miocenici di La Mola e di el Cap de Barbaria.

In generale dunque, il clima caratteristico dell'isola è quello tipicamente mediterraneo, quello incluso nella varietà climatica di tipo caldo - mite. All'interno di questa varietà, l'isola sarebbe climaticamente compresa nella sottovarietà del levante delle Baleari.

Formentera, allo stesso modo che il resto del Mediterraneo Occidentale, durante l'estate sta ad Est dell'anticiclone delle Azzorre. In questo modo, i valori di massima pressione sono dovuti all'estensione verso Est di suddetto anticiclone. Questa situazione è la più comune in estate, si producono i valori massimi termometrici ed il periodo quindi meno piovoso.

Durante l'inverno, inoltre, dovuto ad una situazione molto più meridionale delle alte pressioni atlantiche, l'attività ciclonica compromette pienamente il clima di Formentera, portando così piogge e fronti di perturbazione.

L'isola di Formentera comunque, è quella che presenta il clima più caldo e meno piovoso di tutto l'arcipelago delle Baleari.