La petite taille de l’île de Formentera et le relief peu élevé expliquent que son climat varie très peu d'une zone à l'autre. Il existe néanmoins quelques variations, principalement de température et d’humidité, entre les parties les plus basses de l’île et les promontoires mycéniens de La Mola et du Cap de Barbaria.

En général, le climat de l’île est typiquement méditerranéen, à dominance tempérée à chaude. Dans cette variante, l’île relève climatiquement de la sous-variété levantine-baléare.

Formentera, comme l’ensemble de la Méditerranée occidentale, est tout l’été à l’est de l’anticyclone des Açores. Les hautes pressions sont dues à l’extension vers l’est de cet anticyclone. Cette situation est courante l’été, où la température est élevée et les pluies peu fréquentes.

En hiver, en raison de la situation plus méridionale des hautes pressions atlantiques, l’activité cyclonique affecte pleinement le climat de Formentera, apportant pluies et fronts nuageux.

L’île de Formentera présente le climat le plus doux et le moins pluvieux des Baléares.